Ainsi commence le premier tome de GUNNM. Ce manga nous emmene dans un univers futuriste, foncièrement noir et nous fait suivre les aventures de l'heroïne nommée Gally (Alita dans la version Americaine).
Le monde de GUNNM est séparé en deux :
- en haut ZALEM, la ville dans les nuages où vivent les citoyens dans une cage doré
- en bas la décharge, ou vivent tous les cyborgs et les rebus humains de ZALEM qui se battent pour survivre
 

Gally est retrouvée dans la décharge par Ido, un cybergénéticien qui va la ramener à la vie. Malheureusement notre héroïne a perdue la mémoire et durant les neuf tomes de GUNNM, Gally va recherchée son passée et un sens à sa vie. Elle apprendra à se connaitre a travers les combats qu'elle va mener contre de multiples adversaires.

Elle commencera a travailler en tant qu'Hunter Warrior, une sorte de chasseur de prime. Les Hunters Warriors sont les seuls à garantir un semblant de justice. Ceux-ci travaillent pour les "usines", ces usines fournissent tous les produits de luxe à ZALEM.

Ensuite, elle rentrera dans la ligue de MotorBall. Un jeu populaire sponsorisé par les usines, où les concurents doivent combattre sur un circuit afin de faire trois tours avec une boule en acier. De plus les concurents sont équipés de patins afin de rendre le jeu plus rapide.
Les rêgles de ce sport étant très simple : tous les coups sont permis.

Pour finir, Gally deviendra une "tuned", un agent de ZALEM en surface. Elle aura pour mission de rechercher Desty Nova, un savant fou expert en nanotechnologie venu de ZALEM. Mais son but véritable est de retrouver son ami de toujours Ido.

Elle retrouvera Ido, pour ce rendre compte qu'il ne la reconnait plus. Ido s'est effacer la mémoire afin de ne plus vivre avec le poid du secret de ZALEM que Desty Nova lui à révellé.

Pour finir Desty Nova laissera à Gally le choix de la vie et de la mort de ZALEM et du monde.